國立花蓮高商實用技能學程採「夜間授課」，活動與校務均與進修部同步。

民國九十七年八月設實用技能學程「文書處理科」一班。

民國一○二年八月增設實用技能學程「銷售事務科」一班。

目前擬於民國一○七年八月申設實用技能學程「商用資訊科」一班。